1979 wurde Dr. Weiglein von Egidius Soter, dem Stammesführer der Beriten Asmat, während einer Kultfeier adoptiert. Seitdem wird er auch „Emenji“ genannt, was übersetzt „der, der mit vielen Köpfen kommt“ bedeutet.

Seine große Leidenschaft ist das Reisen. Bereits als 16-jähriger Schüler war er in Afghanistan und Indien. 1982 nahm er an der Camel-Trophy in Papua Neuguinea teil. Danach wirkte er mehrere Jahre aktiv im Camel-Trophy-Team mit.

Seit 1979 gilt sein Hauptinteresse den Kulturen Ozeaniens, hier besonders von Papua, dem indonesischen Teil der Insel Neuguinea. Bis heute führte er in Neuguinea und den Salomonen alleine etwa 250 Expeditionen. Viele Publikationen in der Fachpresse und in Form von Büchern begleiteten die Aktivitäten. Dr. Weiglein ist Mitautor bei Heinrich Harrer und Dieter Kronzucker. Außerdem war der Mediziner an der Organisation und Durchführung von rund 20 Fernsehproduktionen in China, Namibia und insbesondere Papua/Indonesien (ZDF: Paradiesvögel und Drachen sowie Magische Welten aus der Serie Länder-Menschen-Abenteuer) beteiligt. Mit mehr als 30 Touren zur Carstensz Pyramide, kann man davon ausgehen, dass er gegenwärtig den Weltrekord für diesen Berg hält.

1997 begann er mit dem Bau des Baliem Valley Resort, einem bahnbrechenden Tourismusprojekt in der damals wie heute entlegensten Provinz Indonesiens – Papua. Die endgültige Genehmigung für dieses Projekt musste vom damaligen Präsidenten Suharto persönlich erteilt werden. Ende 1999 konnte das Resort eröffnet werden und ist seitdem Ausgangspunkt für Abenteurer und Reisende aus aller Welt.

Heute gilt Werners Hauptinteresse der qualifizierten Entwicklung von Ökotourismusprojekten in Papua und der Weiterentwicklung seiner Kultur- und Bildungsprojekte wie dem Papua Student House, dem Papua Museum und dem Indonesian Culture Center.

Sein Papua-Museum in Gelnhausen, Deutschland, wurde 2015 eingeweiht und kann auf Anfrage besichtigt werden.